10.13263/j.cnki.nja.2022.12.003
基底膜相关基因模型预测前列腺癌患者生化复发
目的:构建和验证前列腺癌(PCa)基底膜的关键基因模型,以预测PCa进展和根治性前列腺切除术后生化复发.方法:根据肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中有关PCa的相关转录组数据、基因突变数据和临床数据,分析正常前列腺组织及PCa组织间基底膜相关基因中的差异表达基因(DEG),并进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析.筛选DEG中预后相关基因,分析其突变情况.根据根治性前列腺切除术后随访情况和生化复发,构建预后风险评分模型.使用基因表达综合(GEO)数据库验证模型的准确性,对模型进行生存分析、主成分分析(PCA)、独立预后分析并构建接受者操作特征(ROC)曲线.免疫组化结果验证模型正确性,构建蛋白互作网络.构建列线图、ROC曲线和校准曲线验证列线图的准确性.结果:共筛选出 85 个DEG,其中上调基因 18 个,下调基因67 个.以其中 11 个基因构建模型,高危组患者发生生化复发的风险高于低危组(HR:3.51,95%CI:2.32~5.32,P<0.001).使用 GEO 数据库数据验证发现,高危组患者发生生化复发的风险显著高于低危组(P<0.001).此外,高危组患者的年龄更大、临床T分期更高、Gleason评分更高、淋巴结阳性率及阳性淋巴结数目更高、残留肿瘤比例更高(P均<0.05).使用患者年龄、pN分期、pT分期、cT分期、Gleason评分及预后风险评分构建了列线图,其ROC曲线下面积高于其他预测指标,校准图显示预测结果和实际结果的一致性.结论:本研究建立了基底膜相关基因预后风险评分模型,并构建了有效的列线图,可预测接受根治性前列腺切除术的PCa患者生化复发的风险.
前列腺癌、生化复发、基底膜、细胞外基质
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R737.25(肿瘤学)
2023-06-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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