一个遗传性痉挛性截瘫4型家系SPAST基因的新变异分析

摘要：

目的:对一个来自山西省长治市的遗传性痉挛性截瘫（hereditary spastic paraplegia，HSP）家系的SPAST基因新变异进行分析，进一步研究该变异基因型与临床表型的关系，明确该家系患者的致病性原因。方法:2019年10月在长治医学院附属和平医院神经内科门诊收集一个HSP家系，抽取先证者及其他8名成员的外周静脉血各2 ml，提取血标本中的基因组DNA，应用二代测序技术（next generation sequencing，NGS）对先证者的痉挛性截瘫相关疾病的基因进行初步筛选，利用HGMD、1000G、OMIM等数据库及PolyPhen2、SIFT等软件对可疑变异进行生物信息学分析。然后利用多重连接依赖性探针扩增（multiplex ligation-dependent probe amplification，MLPA）技术进一步筛选NGS检测后仍为阴性的患者的总缺失/重复变异，并对可疑致病性变异位点进行家系内Sanger测序验证以便明确变异位点在该家系内的共分离情况。最后，参考最新版美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）的序列变异解读指南，对变异位点进行详细分析以明确致病性。结果:该HSP家系共4代47名成员，有10例患者，发病年龄在2~44岁之间。先证者的女儿仅查体可见双侧巴宾斯基征阳性，余患者在此基础上均表现为轻重不一的双下肢痉挛、无力。通过NGS检测技术筛出了2个可疑变异，即SPAST基因c.1057_1058insCC（p.Leu354HisfsTer11）移码变异和DCTN1 基因c.2213A>G（p.Gln738Arg）错义变异。利用Sanger测序对家系进行验证，结果提示该家系受影响的患病成员（先证者的父亲、弟弟、儿子、女儿）均检测到SPAST基因c.1057_1058insCC（p.Leu354HisfsTer11）移码变异，未受影响的正常成员（先证者的妻子、母亲、妹妹、弟媳）均未检测到该变异。而该家系未受影响的正常成员先证者的母亲检测到DCTN1 基因c.2213A>G（p.Gln738Arg）错义变异，余7名成员均未检测到该变异。另外，MLPA结果提示未发现受检者基因存在大片段变异。结论:该HSP家系临床特征和基因结果均高度符合单纯型遗传性痉挛性截瘫4型（SPG4），遗传模式呈常染色体显性遗传。SPAST基因c.1057_1058insCC（p.Leu354HisfsTer11）移码变异在该SPG4家系成员中存在共分离，是该HSP-SPG4家系患者的致病性原因，且为新发现的变异位点。

关键词：痉挛性截瘫，遗传性、突变、序列分析，DNA

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资助基金：山西省卫生健康委科研课题2021003;The Project of Shanxi Provincial Health Commission2021003

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1343-1350