肥胖小鼠肠内容物与肠道黏膜的菌群多样性分析

摘要：

目的 探讨肥胖小鼠肠内容物与肠道黏膜的菌群多样性差异.方法 C57BL/10小鼠高脂喂养12周(10只),收集小鼠结肠内容物与结肠黏膜样本,提取肠道菌群DNA,Illumina平台二代测序.对测序结果进行物种注释、多样性和物种差异分析.结果 肥胖小鼠结肠内容物及结肠黏膜的菌群丰富度和均匀度相同(ACE指数250比285,Chao指数257比291,Shannon指数3.84比3.97,Simpson指数0.05比0.06,P值均>0.05),群落构成大部分相似;但在具体物种组成上有差异,在门水平,肠内容物较肠黏膜有更多的拟杆菌门(56.08％比27.25％,P=0.000),结肠黏膜则拥有更多的厚壁菌门(49.09％比34.27％,P=0.03)和变形菌门(18.48％比3.62％,P=0.001).在属水平,产短链脂肪酸的乳杆菌属在肠内容物中丰度更高(LDA=3.89),革兰阴性的幽门螺杆菌、鞘脂单胞菌属、脱硫弧菌属在结肠黏膜中相对丰度更高(LDA分别为4.78、3.59、4.11).结论 肥胖小鼠结肠黏膜和肠内容物尽管多样性与群落总体构成相似,但门、属水平的菌群组成仍有不同.

关键词：肥胖症、小鼠、肠道菌群

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资助基金：渥太华大学医学院—上海交通大学医学院合作研究课题 University of Ottawa Faculty of Medicine-Shanghai Jiao Tong University School of Medicine Joint Medical Research Project

在线出版日期：2018-10-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：743-748