不同碳水化合物对正常人肠道菌群体外模拟效果的比较

摘要：

目的 比较不同碳水化合物对正常人肠道菌群体外模拟效果的影响,找出适合肠道菌群体外模拟的条件,研究肠道微生物体外制备方法.方法 采集3名正常志愿者的粪便样品,利用以淀粉为主要碳源的培养基VI和以淀粉+多糖为主要碳源的培养基XP,在体外模拟发酵模型中对其菌群结构进行模拟培养.通过提取发酵液细菌基因组DNA,运用PCR-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和16S rRNA基因高通量测序来评价模拟系统的稳定性和模拟效果,通过测定发酵液短链脂肪酸含量来推断细菌代谢情况.结果 体外发酵模型连续运行8d后,3名志愿者的发酵液细菌PCR-DGGE条带一致,不同培养基存在特异的细菌条带.细菌16S rRNA基因高通量测序结果表明,3名志愿者的粪便样品主要由4个细菌门组成,分别是拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和放线菌门.在考虑细菌百分含量的情况下,VI培养基对3名志愿者肠道菌群的模拟相似性是0.847、0.825、0.968,XP培养基为0.927、0.926、0.836.当不考虑细菌百分含量,只考虑细菌种类时,VI培养基对3名志愿者肠道菌群的模拟相似性是0.553、0.580、0.623,XP培养基为0.617、0.520、0.574.VI和XP培养基模拟效果存在个体差异,VI培养基对志愿者3菌群的模拟效果更好,XP培养基对志愿者1、2菌群的模拟效果更好.VI和XP培养基均能较好地模拟拟杆菌和毛螺旋菌属细菌的生长,但VI和XP培养基中也存在各自特异生长的细菌.在发酵罐内检测到短链脂肪酸的含量是15～35 mmol/L,产生最多的是丁酸和丙酸.结论 发酵系统可用于肠道细菌的模拟培养,不同碳水化合物对肠道细菌的体外模拟效果有不同影响,能体外模拟培养出相同的细菌,也有在各培养基中特异性生长的细菌,但对3名志愿者肠道细菌模拟相似性均在80％以上.

关键词：碳水化合物、培养基、肠道菌群、体外模拟

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分类号：S816.7;Q933;TS201.3

在线出版日期：2016-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：381-385