10.3760/cma.j.cn112338-20220720-00645
山东省聊城市2020-2021年小肠结肠炎耶尔森菌食品分离株分子特征分析
目的:了解 2020-2021年山东省聊城市小肠结肠炎耶尔森菌(
Y.e)食品分离株分子特征。
方法:对聊城市市售生肉与肉制品中
Y.e开展分离培养、药敏试验、毒力基因检测、PFGE和全基因组测序(WGS)。利用微生物基因组注释系统对全基因组数据进行拼接组装,对组装基因组开展多位点序列分型(MLST)和核心基因组多位点序列分型(cgMLST),并应用基于WGS的单核苷酸多态性(wg-SNPs)分型方法与美国生物技术信息中心上获取的14株国内外
Y.e的基因组进行遗传进化分析。
结果:165份样品中共检出21株
Y.e,检出率为12.73%,20株
Y.e测序成功。
Y.e携带多种耐药基因和毒力基因,出现多重耐药现象,毒力基因PCR检测显示21株
Y.e呈现2种毒力基因特征;PFGE、MLST和cgMLST聚类分析显示,21株
Y.e呈高度多样性;wg-SNPs遗传进化分析显示20株
Y.e可分为2个进化主分支。
结论:聊城市生肉与肉制品中分离的
Y.e携带多种耐药基因和毒力基因,且分子分型呈现高度多样性,应加强生肉与肉制品中
Y.e分子生物学监测,开展基因组测序及分子分型检测工作,为预防由
Y.e引起的食源性疾病提供理论依据
。
小肠结肠炎耶尔森菌、全基因组测序、毒力基因、耐药性、单核苷酸多态性分型
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2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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