10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.04.011
7~16岁儿童青少年肥胖与DNA甲基化相关性的双生子研究
目的 基于肥胖不一致双生子人群,在全基因组范围内探索与儿童青少年肥胖相关的DNA甲基化位点.方法 2016年在北京市朝阳区、延庆区及房山区招募90对6~17周岁双生子,通过问卷调查和体格检查收集双生子个人信息以及身高、体重、腰围等;通过美国Illumina公司EPIC芯片进行全基因组甲基化检测,采用R 3.3.1软件进行DNA甲基化数据读取、质量控制和统计学分析.利用肥胖不一致同卵双生子对,采用经验贝叶斯配对调整t检验和Levene检验,分别探索与肥胖相关的DNA甲基化差异位点和DNA甲基化变异差异位点.结果 根据研究定义,共纳入23对肥胖不一致同卵双生子对,年龄范围7~16岁.共有817 471个合格CpG位点纳入全基因组相关分析,未发现满足多重校正标准的肥胖相关DNA甲基化阳性位点,P值最小的DNA甲基化差异位点为12号染色体上的位点cg05684382(P=1.26E-06,FDR> 0.05),P值最小的DNA甲基化变异差异位点为16号染色体CMIP基因主体上的位点cg26188191(P=6.44E-06,FDR>0.05),均为EPIC芯片新增位点.结论 基于本研究人群,研究未发现满足显著性要求的肥胖相关DNA甲基化阳性位点,但分析提示cg05684382、cg26188191可能与肥胖发生相关.
肥胖、全基因组DNA甲基化、表观遗传学、儿童青少年、双生子
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National Natural Science Foundation of China81473041;Special Fund for Health Scientific Research in the Public Welfare 201502006,201002007国家自然科学基金81473041;公益性行业科研专项201502006,201002007
2018-06-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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