北京男男性行为人群HIV-1序列和流行趋势分析

摘要：

目的 分析北京MSM人群HIV序列特征,预测北京该人群中HIV流行趋势.方法 汇总本实验室获得的北京MSM人群HIV序列,下载Los Alamos HIV Database中我国MSM人群及其他人群中流行的HIV序列,利用PhyML3.0、BEAST等软件重建北京MSM人群系统发育树、估算突变速率、推断tMRCA、重建群体流行动态参数、计算再生指数R0值,分析北京MSM人群与其他人群HIV流行的相关关系,推断进化和流行特征.结果 北京MSM人群中流行的HIV-1亚型包括B、CRF0 1_AE和CRF07 BC.在全国HIV毒株ML进化树中,北京MSM簇(北京MSM人群所占比例≥40％)共有3簇,即B-1簇、CRF01 AE-1簇、CRF01 AE-2簇.B1簇毒株是由至少3次传入事件进入北京MSM人群的,传入时间分别为1991年3月(1984年7月至1997年2月)、1994年1月(1989年1月至1998年1月)、1991年4月(1984年8月至1996年8月).CRF01_AE毒株由2次传入事件进入北京MSM人群,传人时间分别为2000年12月(1998年3月至2003年1月)和2001年12月(2000年1月至2003年7月).流行特征重塑分析显示,CRF01 AE-1簇近年来增长速度较快、突变速率较高.结论 北京MSM人群中存在多种HIV亚型毒株流行,其中B亚型毒株传入时间最早,但增长趋势趋于平稳;CRF01 AE毒株传入时间较晚、但增长迅速,对HIV在北京地区的流行具有明显的推动作用,因此对CRF01 AE毒株的防控有助于减少该地区HIV的流行.

关键词：男男性行为者、人类免疫缺陷病毒、贝叶斯定理

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资助基金：国家科技重大专项2012ZX10001-002;国家自然科学基金81273137This work was supported by grants from the National Science and Technology Major Project of China2012ZX10001-002;National Natural Science Foundation of China81273137

在线出版日期：2015-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：988-993