广西壮族自治区2008-2009年HIV-1流行毒株基因型及其分布

摘要：

目的 了解广西地区目前HIV-1流行毒株的基因型及其分布.方法 收集广西地区13个市294名2008-2009年新诊断的HIV感染者血浆标本和背景信息,感染途径主要为异性性传播(86.1％).采用RT-PCR法分别扩增HIV-1 gag、pol全长基因(分别为1584 bp和3147 bp)及env基因的C2V3片段(558 bp),序列编辑后用Genotyping及Mega 5.03工具确定病毒的基因型,用Simplot和Recombinant HIV-1 Drawing Tool软件进行病毒基因的重组分析.结果 获得全长gag基因序列270条、全长pol基因序列246条、env基因C2V3区序列223条,确定272例标本的基因型.CRF01 AE占的比例最高(77.6％),其次为CRF08_BC (10.7％)和CRF07 BC(7.4％),有4例B(B')亚型、1例G亚型,还有7例未知重组型.性别、民族间病毒基因型分布的差异无统计学意义.7株新型重组毒株有6株以C RF01_AE为母株,嵌入B和/(或)C的片段,还有1株为CRF07_BC和CRF08 BC的二代重组.结论 广西地区目前流行的HIV-1毒株以CRF01 AE为主,并出现以CRF01_AE为母株嵌入其他毒株基因片段的新型重组毒株,呈现基因组结构复杂化趋势.

关键词：艾滋病病毒1型、HIV基因亚型、分子流行病学

所属期刊栏目：34

分类号：R512.91;F127.67;S855.3

在线出版日期：2013-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：53-56