北京市1998-2004年婴幼儿A3型流感病毒分离株HA1基因序列分析

摘要：

目的了解1998-2004年北京地区婴幼儿中流行的A3(H3N2)亚型流感病毒血凝素基因HA1区的基因变异特点.方法提取该期间采集的呼吸道标本中H3N2亚型流感病毒的RNA,经逆转录-多聚酶链反应扩增得到HA1区基因片段.通过目的基因的克隆、测序或PCR产物直接测序,进行序列分析.结果1998-2004年间北京地区婴幼儿中流行的H3N2亚型流感病毒血凝素HA1区基因均为987 bp,编码一个含329个氨基酸的蛋白质.这些H3N2亚型流感病毒血凝素HA1区的核苷酸和氨基酸同源性分别在95.5%～100.0%和93.0%～100.0%之间,分离年份越近同源性越高.在HA1区有7个糖基化位点非常保守,分别位于8、22、38、63、126、165和285位氨基酸.与1997年以前的毒株相比,1997年以后的毒株均在122和133位增加了一个糖基化位点.自1999年以后的毒株均在144位增加了一个糖基化位点.每年流行的毒株都较前一年的毒株出现了位于不同抗原决定簇或者受体结合位点的氨基酸替换.进化分析显示,每年分离的毒株均与以前的毒株出现了不同程度的变化,不断出现新的进化分支.结论1998-2004年间北京地区婴幼儿中流行的H3N2亚型流感病毒持续不断地发生着点突变,导致抗原性不断发生漂移.加强监测和密切关注其变异动向对防控流感流行有极其重要的意义.

关键词：流感病毒、血凝素基因、序列分析

所属期刊栏目：27

分类号：R18(流行病学与防疫)

资助基金：北京市自然科学基金JS96004;北京市科技新星计划项目2004B34

在线出版日期：2006-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：241-244