加权基因共表达网络分析鉴别与老年肺腺癌免疫相关的关键基因筛选

摘要：

目的:筛选与老年肺腺癌患者肿瘤浸润免疫细胞相关的关键基因。方法:回顾性分析，训练集的基因表达数据来源于癌症基因组图谱数据库，验证集来源于基因表达综合数据库的GSE72094数据集，筛选年龄≥75岁的肺腺癌患者91例，14例匹配的正常样本。肿瘤浸润免疫细胞水平由反卷积算法计算，训练集采用加权基因共表达网络分析筛选与肿瘤浸润免疫细胞水平相关的关键基因，并应用外部数据集验证。结果:在老年肺腺癌患者中，
IKZF1和
PRKCB的高表达与自身免疫疾病和T细胞受体信号通路等相关，其编码的蛋白可与IL2RB、LCK和CD5等多种免疫调节因子相互作用。在
IKZF1和
PRKCB基因高表达患者中，
PD-
L1、
PD-1和
CTLA-4等免疫检查点基因的表达高于低表达患者(均
P<0.01)。验证集结果表明，CD8
+T细胞水平与
IKZF1(
r＝0.75)和
PRKCB(
r＝0.65)的表达相关(均
P<0.01)。
结论:老年肺腺癌患者肿瘤组织中的
IKZF1和
PRKCB表达与肿瘤浸润CD8
+T细胞和免疫检查点基因的表达相关。

关键词：肺肿瘤、腺癌、细胞，免疫、基因组学

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资助基金：中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目2018-I2M-1-002;国家自然科学基金81972199;Chinese Academy of Medical Sciences Innovation Fund for Medical Sciences2018-I2M-1-002;National Natural Science Foundation of China81972199

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1015-1019