生物信息学在预测和鉴定变形链球菌非编码RNA中的应用

摘要：

目的:通过生物信息学方法预测得到变形链球菌基因组中可能存在的非编码RNA,并进行序列鉴定.方法:通过4种生物信息学预测细菌非编码RNA的方法,系统分析变形链球菌UA159基因组,对部分序列采用RT-PCR实验进行初步验证,将实验证实的序列进行家族鉴定.结果:预测得到变形链球菌UA159中的sRNA共334条,对其中40条至少由两种生物信息学方法预测得到的序列,用RT-PCR进行初步验证,检测到5条sRNA.经生物信息学鉴定,2条属于已知的家族序列,3条未检测到家族序列.结论:生物信息学方法在预测和鉴定变形链球菌sRNA方面,有重要的应用价值.

关键词：生物信息学、变形链球菌、非编码PNA

所属期刊栏目：13

分类号：R78(口腔科学)

资助基金：军队“十二五”课题CWS12J126

在线出版日期：2015-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：193-196