CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞和浆细胞浸润在椎间盘退变中的生物信息学分析

摘要：

目的 筛选椎间盘退变(IDD)组织与非退变组织间的关键(hub)基因,并进一步分析IDD组织中免疫细胞浸润情况.方法 从GEO数据库下载IDD表达谱芯片数据集,利用R软件筛选退变组织与非退变组织中的差异表达基因(DEGs),然后构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),筛选出hub基因.最后首次利用科学的反卷积算法(CIBERSORT)分析IDD组织中免疫细胞的浸润情况,以揭示免疫细胞浸润在IDD中的作用.结果 共筛选出166个DEGs和10个hub基因.免疫细胞浸润分析发现,IDD组织中单核细胞与调节性T细胞正相关,嗜酸性粒细胞与单核细胞和调节性T细胞负相关;CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞在IDD组织中浸润较少,而浆细胞在IDD组织中浸润则相对较多;静止期树突状细胞、浆细胞、静止期NK细胞调节性T细胞与其他免疫细胞互作较强,而滤泡辅助性T细胞、M2型巨噬细胞与幼稚性B细胞与其它免疫细胞互作较弱.结论 本结果揭示了IDD中的hub基因,进一步免疫细胞浸润分析表明,CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞和浆细胞与IDD发生发展密切相关,为进一步探讨IDD的分子机制提供新思路.

关键词：椎间盘退变;CD8+T细胞;滤泡辅助性T细胞;浆细胞;CIBERSORT

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资助基金：脊柱疾患疼痛机制研究;治疗甘肃省国际科技合作基地;兰州大学创新创业培育项目;兰州大学第二医院2019年博士研究生培养专项基金项目

在线出版日期：2021-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：193-200