建立MALDI-TOF MS鉴定的海洋致病性弧菌数据库样本前处理的适宜条件

摘要：

目的 探讨建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定海洋致病性弧菌数据库前样本处理的适宜条件,为完善MALDI-TOF MS鉴定该菌入数据库提供参考.方法 将32株海洋致病性弧菌培养至24、48、72 h时,分别用直接转移法、扩展的直接转移法、甲酸提取法得到上机样品,然后用MALDI-TOF MS进行采图鉴定,用SPSS20.0软件进行统计学分析,对样本不同培养时间及3种处理方法的鉴定结果进行比较评价.结果 培养24 h鉴定分数平均值为2.321,属水平鉴定正确率为96.88％,种水平鉴定正确率为90.63％;培养48 h鉴定分数平均值为2.315,属水平鉴定正确率为93.75％,种水平鉴定正确率为90.63％;培养72 h鉴定分数平均值为2.316,属水平鉴定正确率为93.75％,种水平鉴定正确率为87.50％,3种不同培养时间的前处理方法鉴定至属(P=0.129)、鉴定到种(P=0.078),差异均无统计学意义.直接转移法鉴定分数平均值为1.986,属水平鉴定正确率为78.13％,种水平鉴定分数为59.38％;扩展的直接转移法鉴定分数平均值为2.135,属水平鉴定正确率为90.63％,种水平鉴定正确率为78.13％;甲酸提取法鉴定分数平均值为2.306,属水平鉴定正确率为96.88％,种水平鉴定分数为90.63％,3种不同上机前样本处理方法鉴定到属时差异有统计学意义(P=0.006);鉴定到种时差异有统计学意义(χ2=8.691,P=0.013).结论 建立MALDI-TOF MS海洋致病性弧菌数据库时,选择培养时间24 h的甲酸法提取菌体蛋白的前处理方法较适宜,可得到高质量的蛋白指纹图谱和鉴定正确率.

关键词：海洋、弧菌、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱、细菌数据库

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资助基金：全军医学科研计划重点项目资助课题BWS12J014

在线出版日期：2018-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：23-26