重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因的生物信息学

摘要：

目的 通过生物信息学技术分析重症哮喘患者支气管内膜差异表达基因(DEGs)及其在重症哮喘发病中的可能作用.方法 从基因芯片公共数据库(GEO)下载重症哮喘患者支气管内膜研究芯片和测序数据,应用R和Rstudio软件中的limma包获得差异表达基因.应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索基因之间的相互作用,并通过基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,蛋白质互作(PPI)及关键基因分析,预测差异基因可能参与的分子生物学过程.结果 通过芯片分析,共获得247个DEGs,其中127个上调基因,120个下调基因,主要参与的生物学过程包括"细胞迁移的调节"、"神经元的延伸"、"蛋白质泛素化降解"、"负趋化性"和"巨噬细胞自噬调节".PPI分析发现关键基因为:RHOA、YWHAQ、PP1CC、ATP6V1A、CALM2、PSMA5、RPS3A、PSMC5、MRPL13、SEC61B.结论 关键基因(RHOA、YWHAQ、PP1CC、ATP6V1A、CALM2、PSMA5、RPS3A、PSMC5、MRPL13、SEC61B)可能在重症哮喘发生发展过程中发挥了关键作用.

关键词：重症哮喘、支气管内膜、差异表达基因、富集分析、权基因共表达网络分析

所属期刊栏目：17

分类号：R735.2;Q75;TP3

在线出版日期：2023-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：27-33