基于生物信息学技术筛选哮喘严重程度相关核心基因

摘要：

目的 研究筛选与哮喘严重程度相关的核心基因.方法 从GEO数据库中下载哮喘患者及健康对照的支气管活检组织测序基因表达谱(GSE147878)数据集,使用GEO2R在线分析工具筛选与哮喘相关的显著差异表达基因,应用R语言中的WGCNA包分析得出与哮喘严重程度密切相关的共表达基因模块,提取相应基因模块中的基因,进行KEGG信号通路富集分析,同时导入STRING数据库进行蛋白质相互作用网络分析,最后用Cytoscape软件中的Cytohubba插件筛选出核心基因.结果 应用多种生物信息学技术筛选出10个可能与哮喘严重程度相关的核心基因:EP300、AKT1、AR、YY1、CEBPA、CREB1、NR3C1、BRD4、POLR2A、CHD8.结论 应用多种生物信息学技术筛选获得了与哮喘严重程度评估相关的核心基因,为哮喘的发生发展机制研究提供新的参考.

关键词：哮喘、加权基因共表达网络分析、差异基因、生物信息学

所属期刊栏目：16

分类号：R739.4;R-058;R318

资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）2018YFC2002402

在线出版日期：2023-03-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：595-603