埃博拉病毒包膜糖蛋白进化特征分析

摘要：

目的 研究埃博拉病毒包膜糖蛋白的进化和变异特征.方法 从美国生物信息中心(NCBI)数据库选取1976至2014年埃博拉病毒包膜糖蛋白氨基酸序列100条,通过多序列比对和蛋白进化树分析埃博拉病毒包膜糖蛋白的进化和变异特征.结果 1976至2014年,不同亚型埃博拉病毒包膜糖蛋白氨基酸序列间的同源性为54.00％ ～ 65.00％,同亚型包膜糖蛋白氨基酸序列同源性为95.00％ ～ 100.00％.2014年在不同地域分离到的同亚型埃博拉病毒的包膜糖蛋白氨基酸序列并不完全一致,但是变异很小,同源性达到了99.70％ ～ 100.00％.2014年来自塞拉利昂的扎伊尔-埃博拉病毒包膜糖蛋白氨基酸同源性达到了100.00％,但是米自几内亚的三条扎伊尔-埃博拉病毒糖蛋白氨基酸序列有一定变异.不同亚型埃博拉病毒包膜糖蛋白分别在进化树的不同分支上:2014年分离自塞拉利昂的扎伊尔-埃博拉病毒包膜糖蛋白在一大分支上;1976至2014年分离自塞拉利昂以外国家的扎伊尔-埃博拉病毒糖蛋白在另一个大分支上.结论 埃博拉病毒包膜糖蛋白氨基酸变异具有时间性和地域性.2014年流行于不同地域的扎伊尔-埃博拉病毒可能是同一来源的两个不同变种,没有迹象表明不同亚型埃博拉病毒之间具有“混合杂交现象”发生.

关键词：埃博拉病毒、病毒包膜蛋白质类、序列同源性、氨基酸、进化树

所属期刊栏目：8

分类号：S858.31;S667.2;Q946

在线出版日期：2015-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：143-146