人牙源干细胞数据独立采集蛋白质组学方法的建立

摘要：

目的:探讨人牙源性干细胞（DSC）的数据独立采集（DIA）蛋白质组学的建立方法。方法:2021年8月至2022年9月于苏州口腔医院收集牙齿，培养来自不同个体的牙髓干细胞（DPSC）、牙龈间充质干细胞（GMSC）、牙周膜干细胞（PDLSC）、根尖乳头干细胞（SCAP）和人脱落乳牙来源的干细胞（SHED），每种细胞各3个样本，共计15个样本进行DIA蛋白组学测序。通过唯一肽段分布和蛋白质覆盖分布、蛋白质质量分布评估蛋白质鉴定结果，通过组内变异系数（CV）、主成分分析及样本定量相关性等方面来评估DIA数据的质量。结果:从细胞中提取的蛋白质样本合格，总样本中共鉴定出8 662个蛋白质。蛋白质鉴定的基本统计表明所鉴定的蛋白质是可靠的。差异蛋白分析显示，DSPC组与其他各组（GMSC、PDLSC、SCAP和SHED）比较，上调和下调的蛋白分别为125、168、100、102和106、107、94、107个。差异蛋白的热图显示，同DPSC比较，GMSC、PDLSC、SCAP和SHED均有不同高表达的蛋白图谱。京都基因和基因组百科全书数据库（KEGG）分析表明不同DSC的蛋白质富集在不同的信号通路。结论:本研究成功建立了不同DSC的DIA蛋白质组学分析方法，为后续研究奠定了基础。

关键词：干细胞、人牙源性干细胞、数据独立采集、蛋白质组学

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资助基金：苏州市姑苏卫生人才项目SYSD2019067;Suzhou Gusu Health Talent ProjectSYSD2019067

在线出版日期：2024-03-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：12-21