10.3877/cma.j.issn.1674-1366.2022.04.002
长链非编码RNA基因芯片技术筛选口腔扁平苔藓唾液外泌体差异表达基因
目的:研究利用基因芯片技术筛选长链非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)在口腔扁平苔藓(OLP)唾液外泌体中的异常表达,分析和探讨lncRNA和mRNA在OLP发生、发展中可能的分子机制。方法:收集9例OLP患者和3名健康对照者的唾液样本,分离得到样本中的外泌体。对外泌体进行纳米颗粒跟踪分析(NTA)检测、透射电子显微镜检测和外泌体特异性生物标志物的蛋白免疫印迹法(Western blot)鉴定。使用lncRNA基因表达芯片技术比较糜烂型OLP患者(EOLP组)和网纹型OLP患者(ROLP组)与健康对照者唾液外泌体中lncRNA和mRNA的表达谱,筛选得到差异表达基因并进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:NTA、透射电子显微镜和Western blot检测均证实分离得到外泌体。唾液外泌体lncRNA基因表达芯片结果显示,与对照组相比,EOLP组中有267个差异表达的lncRNA,其中上调99个、下调168个;有122个差异表达的mRNA,其中上调38个、下调84个;ROLP组中有201个差异表达的lncRNA,其中上调83个、下调118个;有86个差异表达的mRNA,其中上调32个、下调54个。两组有50个相同的差异表达mRNA和128个相同的差异表达lncRNA。GO和KEGG分析显示,差异表达基因涉及到基因转录、蛋白翻译和免疫反应等多个生物学过程。结论:本研究确定了OLP患者唾液外泌体中lncRNA和mRNA的表达谱,筛选出了与OLP相关的差异表达lncRNA和mRNA,可作为诊断和阐明OLP发病机制的重要候选者。
口腔扁平苔藓、唾液、外泌体、长链非编码RNA、信使RNA
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深圳市科技计划JCYJ20190807145815129、JCYJ20180228164611173;Science and Technology Planning Project of ShenzhenJCYJ20190807145815129, JCYJ20180228164611173
2022-11-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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