牙龈卟啉单胞菌外膜囊泡差异表达mRNA的生物信息学分析

摘要：

目的 探讨牙龈卟啉单胞菌(P.gingivalis)W83与ATCC33277外膜囊泡mRNA表达谱的差异.方法 超速离心法分离W83和ATCC33277来源的外膜囊泡,进行粒径检测、电镜及Western blot鉴定;高通量测序检测W83和ATCC33277外膜囊泡mRNA表达谱,筛选差异表达的mRNA,进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果 牙龈卟啉单胞菌W83和ATCC33277分离的外膜囊泡符合囊泡特征;W83外膜囊泡中鉴定出1629个mRNA,ATCC33277外膜囊泡中鉴定出1505个mRNA,差异表达的mRNA共594个.差异具有统计学意义的mRNA参与的途径包括生物膜形成-霍乱弧菌(P=0.011)、核糖体(P=0.015)和细菌双组分调节系统(P=0.026).结论 牙龈卟啉单胞菌W83与ATCC33277外膜囊泡mRNA表达存在差异.

关键词：牙龈卟啉单胞菌、外膜囊泡、高通量筛选、双组分信号转导系统

所属期刊栏目：15

分类号：R78;S858.292;Q78

资助基金：国家自然科学基金;广东省自然科学基金;广东省自然科学基金

在线出版日期：2021-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：135-141