基于数据挖掘分析低氧诱导因子-3α在头颈鳞状细胞癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 探讨头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者中低氧诱导因子-3α(HIF-3α)的表达与其DNA甲基化水平的关系,研究HIF-3α表达异常对HNSCC患者预后的影响.方法 以肿瘤基因组(TCGA)数据库为研究基础,分析HIF-3α在530例HNSCC及50例正常头颈组织中的mRNA表达及DNA甲基化水平,独立样本t检验进行统计分析;Pearson相关性分析HNSCC组织中HIF-3αDNA甲基化水平与其mRNA表达之间的关系.Kaplan-Meier生存分析法研究HIF-3α表达与HNSCC患者的总生存率及无复发生存率之间的关系,Log-rank检验进行统计分析.对HIF-3α高表达组与低表达组肿瘤组织进行差异表达基因分析,同时对差异表达基因进行基因富集分析(GSEA),研究其可能参与的生物学功能.结果 与正常组织相比,HNSCC组织中HIF-3α的mRNA表达水平降低,表达量分别为(4.809±0.293)和(3.100±0.092),差异有统计学意义(t=5.369,P<0.001);而DNA甲基化水平升高,表达量分别为(0.158±0.010)和(0.362±0.009),差异有统计学意义(t=6.806,P<0.001);HNSCC组织中HIF-3α的mRNA表达水平与其DNA甲基化水平呈负相关(r=-0.46,P<0.001);HIF-3α低表达的HNSCC患者总生存率及无复发生存率均显著低于HIF-3α高表达组(HR=0.701,P=0.02;HR=0.517,P=0.004);GSEA基因富集分析发现,HIF-3α低表达组和高表达组差异基因主要富集在P53信号通路、凋亡通路和免疫反应通路.互作蛋白分析显示,HIF-3α可能与血管内皮生长因子A(VEGFA)、CREB结合蛋白(CREBBP)等相互作用.结论 HIF-3α在HNSCC中表达降低与其DNA甲基化水平升高密切相关,是潜在的预后预测分子指标.

关键词：癌、鳞状细胞、头颈部肿瘤、低氧诱导因子、低氧微环境

所属期刊栏目：14

资助基金：国家自然科学基金;广州市科技计划

在线出版日期：2020-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：14-18