生物信息学分析DHX9在肝细胞癌中表达及临床意义

摘要：

目的 探讨DEAH盒解旋酶9(DHX9)在肝细胞癌(肝癌)早期诊断和治疗中的作用.方法 利用GEPIA、Oncomine、The Human Protein Atlas在线平台从DNA、mRNA和蛋白质3个层面分析肝癌组织和正常肝组织中DHX9的表达情况.通过UALCAN、Kaplan-Meier Plotter在线平台分析DHX9与肝癌临床特征和预后的关系.cBioPortal在线平台分析肝癌中的DHX9基因突变情况,LinkedOmics、WebGestalt在线平台分析DHX9基因的生物学意义.STRING在线平台构建DHX9蛋白相互作用网络.结果 GEPIA、Oncomine、The Human Protein Atlas在线平台分析结果显示,与正常肝组织相比,DHX9 mRNA、DHX9 DNA、DHX9蛋白质在肝癌中明显高表达.DHX9 mRNA表达与年龄、TP53突变、疾病分期和肿瘤分级有关.Kaplan-Meier Plotter在线平台分析显示,DHX9 mRNA低表达肝癌患者的总体生存、疾病特异性生存和无进展生存预后更好(HR=1.48,1.62,1.57;P<0.05).DHX9基因突变发生率17％(63/370),大多数基因突变为扩增和mRNA增高.DHX9基因突变的表达水平与肿瘤组织学分级有关(P=0.017).DHX9基因主要参与DNA修复、有丝分裂、DNA代谢、细胞周期调控、解螺旋酶活性、转录因子结合等活动.京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析显示,DHX9基因在mRNA监测通路、RNA转运、酪氨酸代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等中富集.DHX9蛋白参与DNA修复途径,促进核糖体招募、翻译起始,细胞的生长和分裂等活动.结论 DHX9基因主要参与DNA修复、RNA转运、细胞周期调控、PPAR信号通路等重要生物学过程.DHX9在肝癌组织中高表达,与肿瘤分级、分期有关,且低表达患者生存预后较好.

关键词：癌,肝细胞;计算生物学;早期诊断;DEAH盒解旋酶9

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在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：636-641