两例成骨不全症患者候选剪接变异的致病性鉴定
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10.3760/cma.j.cn121113-20200813-00498

两例成骨不全症患者候选剪接变异的致病性鉴定

引用
目的:对2例中国汉族成骨不全症(osteogenesis imperfecta,OI)患者进行突变检测,对其候选剪接变异进行致病性鉴定。方法:采用常规酚-氯仿法从2例中国汉族OI先证者的外周血中提取基因组DNA,通过全外显子组测序(WES)进行致病突变筛查;针对检出的可能引起RNA剪接异常的疑似致病变异,构建Minigene分析变异对于剪接的影响,进而确定其致病性。结果:在先证者1中发现可能影响剪接的杂合变异:COL1A1:c.858+1_858+5delGTAAG;先证者2同时存在COL1A2的两个变异,一个为可能引起异常剪接的杂合变异c.1405-7C>T,另一个为杂合错义变异c.2972G>T(p.G991V)。Minigene实验分析证实家系1的变异导致COL1A1基因第12外显子发生跳跃,家系2变异位点c.1405-7C>T对COL1A2的转录后剪接没有影响。先证者2的COL1A2基因的G991为一个高度保守的氨基酸,经生物信息学分析c.2972G>T(p.G991V)可能为真正的OI致病变异。结论:先证者1的COL1A1剪接位点变异c.858+1_858+5delGTAAG是导致OI的致病性变异;排除先证者2中COL1A2变异c.1405-7C>T的致病性,确定COL1A2基因变异c.2972G>T(p.G991V)为先证者2的致病原因。针对WES提示的剪接变异进行Minigene分析,不仅实现了突变致病性鉴定,丰富了OI的突变谱,而且为患者产前诊断和后续机制研究奠定了基础。

骨发育不全、遗传学研究、剪接体、遗传变异、遗传关联研究

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国家重点研发计划2016YFE0128400;2016YFC0905100;中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目2016-12M-3-003;国家自然科学基金81871749;National Key Research and Development Program of China2016YFE0128400; 2016YFC0905100;CAMS Innovation Fund for Medical Sciences2016-I2M-3-003;National Natural Science Foundation of China81871749

2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共8页

576-583

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0253-2352

12-1113/R

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