类风湿关节炎患者外周血环状RNA表达谱研究

摘要：

目的 筛选RA患者外周血中差异性表达的环状RNA(circRNA)并进行生物信息学分析,以探讨外周血circRNA在RA发病中的作用.方法 采用circRNA芯片对3例RA患者和3名健康对照的外周血中的circRNA进行筛查,用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理,通过Fold Change和P值进行筛选,采用t检验,寻找2组样本间差异表达的circRNA,并对差异表达的circRNA进行生物信息学分析.结果 芯片筛查结果提示有36个circRNA在RA组和对照组之间差异有统计学意义,14个circRNA下调,22个circRNA上调.对这些circRNA所涉及的基因进行基因本体论(GO)分析,结果提示,这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等.对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预测,其中有1个circRNA(hsa circ 0005397)预测结果中有1个miRNA (hsa-miR-125a-3p)在文献中得到验证,用Cytoscape软件对三者之间的网络关系进行了预测.结论 RA患者外周血中的circRNA出现多个差异性表达,circRNA可能参与RA调控机制.

关键词：关节炎、类风湿、靶基因、生物信息学、环状RNA

所属期刊栏目：20

分类号：R5;R714.252.02;R471

在线出版日期：2016-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：541-546,前插1