在中国人群中鉴定发现PBX1基因为1q 23-24区域新的狼疮易感基因

摘要：

目的用连锁不平衡(linkage disequilibrium)的方法对1号染色体狼疮易感区域进行进一步的精细定位,并由此定位新的系统性红斑狼疮(SLE)候选基因.方法用9对高密度的微卫星标记对1q23-24易感区域进行连锁不平衡分析;用延伸型传递不平衡试验(ETDT)、Gene Hunter和家系为基础的相关分析(FBAT)软件分析连锁不平衡的结果;用TaqMan荧光实时定量聚合酶链反应(PCR)检测候选基因mRNA的表达量;用等位基因分型PCR对候选基因内的4个SNP分型.结果①发现微卫星标记D1S2628 (P＝0.000 987,Pc＝0.001 2)和D1S2673 (P＝0.007 082,Pc＝0.010 4)的等位基因存在整体的显著传递不平衡);②发现D1S2628-119 bp (Pc＝0.001 2;传递∶不传递＝91∶45,P＝0.000 1)和D1S2673-103 bp (Pc＝0.010 4,传递∶不传递＝109∶67,P＝0.0016)等位基因从杂合子父母优势传递给受累后代;③在中国汉族红斑狼疮核心家系中单倍型D1S2628 (119 bp)-D1S2673 (103 bp) (传递∶不传递＝43∶18,P＝0.001 4)和单倍型D1S2628 (119 bp)-D1S2673 (107 bp) (传递∶不传递＝29∶12,P＝0.007 9)存在传递不平衡.在中国汉族SLE患者中PBX1的mRNA的表达量显著下降(P＜0.000 1).PBX1基因中的单倍型SNP1(G)-SNP2(C)优势传递给受累后代.结论在中国汉族人群的1q23区存在与微卫星标记D1S2628和D1S2673物理距离相近的SLE易感基因;PBX1基因表达较低,其SNP单倍型与SLE易感显著相关.这提示:PBX1基因可能是一个新的候选基因.

关键词：红斑狼疮、系统性、转录因子、连锁不平衡、基因

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分类号：R593(全身性疾病)

资助基金：国家自然科学基金30000154,30271224;上海市科技发展基金01JC14029;教育部霍英东教育基金会高等院校青年教师基金81030;国家高技术研究发展计划863计划2002AA229101;上海市科委资助项目02QMB1404

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：399-405