复发鼻咽癌差异基因分析及染色体定位初步研究

摘要：

目的 通过基因芯片和生物信息学来筛选复发鼻咽癌(recurrent nasopharyngeal carcinoma,rNPC)差异基因及染色体定位和功能分析.方法 选择初发鼻咽癌(primary nasopharyngeal carcinoma,pNPC)和rNPC,应用Affymetrix Gene1.0 ST芯片筛选差异基因;应用生物信息学对差异基因进行染色体定位和功能分析.结果 差异基因共44个,其中下调基因36个,上调基因8个.基因功能分类显示,下调基因大部分属于酶活性基因(10个,27.8%),其次为钙黏合基因(7个,19.4%)、蛋白结合基因(5个,13.9%),这3类基因占了下调基因总数的61.1%,另外,受体活性基因(4个,11.1%),转录因子基因和三磷酸腺苷黏合基因各2个(各占5.6%),细胞外基质黏合基因和生长因子黏合基因各1个(各占2.8%),4个基因的功能未知(11.1%);上调基因中,3个基因的功能未知(37.5%),酶活性基因(2个,25.0%),受体活性、钙黏合、电压门压通道调控基因各1个,各占12.5%.这些差异基因分布在大多数染色体上,主要分布在1和17号染色体上.1号染色体上包含10个基因(22.7%),17号染色体包含5个基因(11.3%).结论 差异基因分布在大多数染色体上,但主要分布在1和17号染色体上,酶活性、钙黏合及蛋白结合基因这三类差异基因可能在rNPC中扮演着重要的角色,需要进一步深入研究.

关键词：鼻咽肿瘤、肿瘤复发、局部、寡核苷酸序列分析、基因表达、染色体定位

所属期刊栏目：45

分类号：R76(耳鼻咽喉科学)

资助基金：浙江省科技厅科技攻关项目2007C23G2090017;温州市科技局科研基金Y2005AOB

在线出版日期：2010-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：47-51