基于基因表达谱筛查小鼠脑缺血再灌注后星形胶质细胞活化相关基因

摘要：

目的 利用全基因组表达谱芯片筛查脑缺血再灌注后星形胶质细胞中起关键作用的信号通路,并对星形胶质细胞活化过程中可能参与的关键基因进行分析.方法 从美国基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)数据库中选取小鼠星形胶质细胞基因表达谱芯片(Affymetrix Gene Chip Mouse Genome 4302.0 Arrays)数据8张.小鼠分为脑缺血再灌注组(脑缺血1h再灌注24h)和假手术组,每组4只.筛选差异表达基因,并进行信号通路分析,筛选核心信号通路,分析具有重要调控作用的基因.结果 共筛查出1966个在脑缺血再灌注后星形胶质细胞中差异表达的基因,其中有1210个基因表达上调,756个基因表达下调.信号通路分析得到154个差异表达的信号通路.进一步分析发现,在脑缺血再灌注后参与星形胶质细胞活化的关键信号通路主要有丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)信号通路、凋亡(apoptosis)、细胞周期(cell cycle)和p53信号通路.对信号通路中差异基因的分析发现,Flnc和Ccnd1基因在脑缺血再灌注后星形胶质细胞活化过程中具有重要作用.结论 脑缺血再灌注后星形胶质细胞中有大量基因表达异常.通过对差异基因的分析,筛选出脑缺血再灌注损伤过程中潜在的发挥重要调控作用的新靶点.

关键词：脑缺血再灌注、基因芯片、差异表达、信号通路

所属期刊栏目：12

分类号：R32;R74

资助基金：国家重点研发计划2017YFC1307501首都医科大学附属北京天坛医院青年科研基金项目No.2016-YQN-19国家自然科学基金81701138

在线出版日期：2017-12-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1000-1004