10.19540/j.cnki.cjcmm.20230115.103
灰毡毛忍冬MYB转录因子家族成员的挖掘及鉴定
MYB转录因子作为最大的转录因子家族之一,在调控花发育过程中起到重要作用.该文首次从灰毡毛忍冬转录组数据中鉴定出 3 条 1R-MYB,47 条R2R3-MYB,2 条 3R-MYB和 1 条 4R-MYB转录因子,对其理化性质、保守结构域、家族进化关系及蛋白结构、功能信息及表达进行分析.结果表明,不同品种灰毡毛忍冬中 53 个MYB转录因子家族成员基因在保守基序、蛋白理化性质及结构、功能等各有不同,表明其在进化中具有保守性和多样性.表达分析表明LmMYB在品种间(野生型、湘蕾型)及器官间(花、叶)均存在转录水平上的显著差异,且部分基因特殊表达.在 53 条LmMYB中有 43 条在花、叶中均有表达,其中 9 个LmMYB成员在 2 个品种灰毡毛忍冬中在转录水平上存在显著差异,且在野生品种中上调表达.结合家族进化分析和表达分析推测LmMYB蛋白主要在生长发育、逆境胁迫、类黄酮次生代谢等方面发挥重要转录因子调控功能.该研究结果为后续研究灰毡毛忍冬MYB转录因子家族具体功能机制提供了理论基础和参考依据.
灰毡毛忍冬、MYB、生物信息学、转录因子
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Q94;S601;S512.1
国家自然科学基金;国家自然科学基金;湖南省自然科学基金项目;湖南省自然科学基金项目;现代农业产业技术体系;湖南省一流专业建设点项目;湖南中医药大学中药学一流学科项目;湖南省研究生科研创新项目;湖南中医药大学研究生科研创新项目;湖南中医药大学研究生科研创新项目;湖南省大学生创新训练项目
2023-05-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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2103-2115