10.19540/j.cnki.cjcmm.20220514.104
红花NAC基因家族鉴定及干旱胁迫响应分析
NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子是植物最大的转录基因家族之一,在植物应对干旱胁迫中具有重要作用.为了研究NAC基因家族在红花中的数量及功能,该文以红花的全基因组数据为基础,利用生物信息学手段对红花NAC基因家族成员进行鉴定,并分析了其理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、保守结构域及保守基序.同时,利用qRT-PCR方法分析了 4个NAC基因在干旱胁迫处理不同时间后的转录水平.结果表明,红花NAC基因家族有87个成员,不均匀分布在11条染色体上,其中第12号染色体不存在NAC基因;87个NAC基因氨基酸数目为103~974个,CDS数目为3~9个;进化分析可将其分为17个亚家族;保守结构域分析大多数基因含有5个保守的亚结构域A~E;保守基序分析发现,motif2在NAC基因中最保守.表达模式分析发现干旱胁迫不同处理时间后,4个与抗旱相关的NAC基因在叶片中的转录水平均呈上调趋势,推测这4个NAC基因可能与红花抗旱性有关.该研究为红花NAC转录因子进一步功能研究奠定了理论基础,为培育耐旱性红花品种提供参考依据.
红花、NAC基因家族、干旱胁迫、转录水平
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S511;Q945;S601
国家自然科学基金32072123
2022-12-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共10页
5520-5529