10.19540/j.cnki.cjcmm.20220515.102
不同年份防风转录组学分析及有效成分生物合成关键基因挖掘
防风为常用大宗药材,为探究防风活性成分色原酮和香豆素合成途径关键酶基因及其表达情况,该研究对一年生(S1)和二年生(S2)防风进行了转录组测序和生物信息学分析.利用IllumiinaHiSeq平台进行测序,共得到40.8 Gb的数据.采用 Trinity 软件进行拼接后,得到 110 732 条 transcripts 和 86 233 条 unigene.与 NR、Swiss-Prot、GO、KEGG、PFAM 各大数据库进行了比对和注释.注释结果显示防风与野胡萝卜同源的序列最多.KEGG代谢富集分析显示差异基因主要富集在植物激素信号传导、苯丙烷生物合成和黄酮类生物合成途径中.在防风有效成分合成相关通路中共鉴别出27条差异表达unigene,包含13种酶.二年生防风较一年生防风PAL、BGL、C4H、4CL、CYP98A、CSE、REF、CCoAOMT均上调表达,CHS、CAD、COMT均下调表达,HCT、POD既有上调表达的又有下调表达的unigene.其中PAL、C4H、4CL、BGL、CHS可作为防风有效成分合成的候选基因.对关键的4个酶基因进行RT-qPCR验证,基因表达结果与转录组测序一致.该研究丰富了防风的遗传数据信息,为鉴定参与次生代谢产物生物合成的候选基因提供了有力支持.
防风、转录组、不同年份、差异表达基因、生物合成途径
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S512.1;Q939.4;S855.3
内蒙古自治区重大科技专项;现代农业产业技术体系;陕西中医药管理局项目;陕西中医药大学思邈人才专项-思邈新星项目
2022-11-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
4609-4617
