马蓝等79种植物分支酸合成酶的生物信息学分析
分支酸合成酶(chorismate synthase,CS,EC:4.2.3.5)催化5-烯醇式莽草酸-3-磷酸生成分支酸,是生物体内分支酸合成所必须的酶.目前,Genbank报道了79种高等植物CS的氨基酸序列.该研究采用生物信息学方法对马蓝等79种植物共125条CS氨基酸序列的组成成分、信号肽、导肽、疏水性/亲水性、跨膜结构、卷曲螺旋结构、蛋白二级结构、三级结构及其功能域等进行预测和分析,并构建了CS蛋白家族的系统进化树.进化分析结果表明这79种植物的CS被分为8个类群;而氨基酸序列同源性比对结果显示,马蓝CS的氨基酸序列与芝麻、烟草、马铃薯等植物的同源性比较高.所有植物CS的开放阅读框在1300 bp左右,相对分子质量为50 kDa左右,等电点(pI)在5.0～8.0,呈微碱性.该研究克隆得到的马蓝CS的开放阅读框为1326 bp,氨基酸残基数为442个,相对分子质量47 kDa,等电点(pI)为8.11.CS氨基酸肽链表现出明显的疏水区和亲水区,不存在信号肽,可能存在跨膜结构域.蛋白质二级结构中最主要的结构元件是无规则卷曲和α-螺旋,并含有活性结构域、PLN02754保守域和FMN结合位点3个主要的组成结构域.研究所获得的结构信息,可为今后进一步深入研究植物CS的构效关系和结构改造提供一定的科学依据.
马蓝、分支酸合成酶、生物信息学、构效关系、结构改造
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国家自然科学基金项目81573517,31670292;国家自然科学基金-促海峡两岸科技合作联合基金项目U1405215
2018-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
721-730
