黄芩葡萄糖醛酸水解酶基因的克隆、生物信息学分析及表达

摘要：

该文从黄芩叶中提取总RNA,利用RT-PCR技术克隆了葡萄糖醛酸水解酶基因(sbGUS)的全长(GeneBank登录号KR364726).该基因全长1 584 bp,含有1个完整的开放阅读框,编码527个氨基酸,为不稳定亲水蛋白.生物信息学分析结果显示sbGUS编码蛋白分子质量为58.724 8 kDa,等电点pI 5.55,含有信号肽和1个跨膜区,具有1个水解酶超级家族结构域1个未整合的转移糖苷酶催化结构域.二级结构中α-螺旋(Alpha helix)占25.62％,延伸链(extended strand)占28.84％,β-转角(Beta turm)占13.28％,无规卷曲(random coil)占32.26％.序列比对和系统进化分析表明,sbGUS基因与黄芩(BAA97804.1)核苷酸相似性为98.93％、氨基酸相似性为98.29％,在9个位置氨基酸不同.实时荧光定量PCR检测sbGUS在根中表达丰度最高,其次为花和茎,在叶中表达量最低.这为进一步鉴定sbGUS的功能及开展黄芩素的合成生物学研究奠定基础.

关键词：葡萄糖醛酸水解酶、生物信息学分析、黄芩素、克隆

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资助基金：国家自然科学基金项目31570327,31070292;国家科技支撑计划项目2011BAI0301-02;吉林省科技成果转化项目20130303089YY

在线出版日期：2016-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：4370-4377