不同种植年限黄连根系土壤细菌PCR-DGGE分析

摘要：

该研究应用PCR-DGGE技术,分析了不同种植年限正常生长、发病的黄连Coptis chinensis的根际和非根际土壤的细菌种群多样性指数,并选取代表性DGGE条带进行克隆测序,构建细菌系统发育树状图.结果表明,正常土样与发病土样土壤细菌种群差异明显,且发病土样多样性指数(H)高于正常土样;代表性条带克隆测序结果表明,黄连种植土壤中未培养细菌为优势菌群,其余类群为食酸菌属、芽孢杆菌属、不动杆菌属、未培养克吕沃尔菌属以及未培养丛毛单胞菌,未发现已报道的植物病原细菌.发病土样中Clone band d的谱带亮度高于正常土样,该条带菌株在分类上属于食酸菌属.显然,黄连种植过程中,根际土壤中细菌种群发生了改变,其中食酸菌属的细菌在发病根际土壤增加,很可能与黄连病害发生有关.

关键词：黄连、细菌种群、根际土壤、16S rDNA、PCR-DGGE

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资助基金：国家科技支撑计划项目2012BAD14B18:四川省科技支撑计划项目2014NZ0044

在线出版日期：2015-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：3147-3151