分离培养方法结合PCR-SSCP技术分析六神曲中的真菌类群

摘要：

目的:采用传统分离培养方法结合PCR-SSCP技术对六神曲中的真菌类群进行分析,为全面了解六神曲中的功能菌群奠定基础.方法:采用直接分离法获得六神曲中的可培养真菌,根据形态学及DNA序列特征对得到的真菌进行鉴定;同时提取六神曲中真菌的总DNA,采用基于β-tubulin基因片段的聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术分析其中所包含的真菌种类.结果:采用传统分离培养的方法,从生神曲中只得到黄曲霉Aspergillus flavus和米根霉Rhizopus oryzae;从焦神曲中得到黄曲霉A.flavus和黑曲霉A.niger.PCR-SSCP分析结果显示生神曲中含有3属5种真菌,其中A.ambiguus 以及A.ivoriensis占优势,相对多度分别为57％,35％,与培养方法共有的种类为A.flaw,相对多度仅为4％;但未从焦神曲中获得阳性克隆.结论:在六神曲中的真菌多样性分析中,通过PCR-SSCP分析技术能从DNA水平上发现传统分离培养方法无法获得的真菌种类,结合2种方法可以更全面地解析参与六神曲发酵的功能真菌.

关键词：六神曲、可培养真菌、β-tubulin基因、PCR-SSCP技术、真菌类群

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资助基金：国家自然科学基金项目30973882,81274071

在线出版日期：2015-01-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：4169-4173