脱落酸对铁皮石斛Ty1-copia类反转录转座子转录活性的影响

摘要：

研究以Ty1-copia类反转录转座子反转录酶区域的简并引物,对100 μmol·L-1脱落酸(ABA)处理的铁皮石斛进行反转录PCR(RT-PCR)扩增,得到260 bp左右的目的条带,说明100 μmol·L-1的ABA能诱导Ty1-copia类反转录转座子转录活性的表达.将目的条带回收、克隆和测序后分析得到42条Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守序列,该序列变异性较大,核苷酸序列长度247～ 266 bp,同源性为46.3％～98.9％.经plantCARE软件分析发现与铁皮石斛基因组所分离的Ty1-copia类反转录转座子一样,存在多个受胁迫条件作用的调控元件、多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box的保守序列及其他一些调控元件;但有转录活性的铁皮石斛Tyl-copia RT序列中与胁迫条件作用相关的调控元件明显增加.翻译成氨基酸后,有15条序列出现不同程度的终止密码子突变,19条序列出现移码突变,保守序列“SLYGKQ”全部发生不同程度的突变.其氨基酸序列经过系统聚类后可分为5类;且与基因组Tyl-copia RT序列聚类后发现多数发生转录的Tyl组反转录转座子RT序列与基因组Tyl组反转录转座子RT序列亲缘关系较远,说明经ABA诱导后发生转录的Tyl组反转录转座子RT序列与基因组Tyl组反转录转座子RT序列有很大的差异.

关键词：铁皮石斛、脱落酸(ABA)、Ty1-copia类反转录转座子、反转录酶(RT)、转录活性

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在线出版日期：2014-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1788-1794