丹参SmNAC1基因的克隆和生物信息学分析

摘要：

为了研究丹参中特有的NAC转录子在丹参生长发育、激素调节和抗逆胁迫应答调节中的功能,对丹参NAC转录因子进行了克隆和分析.根据丹参毛状根cDNA文库中筛选到的NAC EST序列,克隆了丹参SmNAC1的cDNA全长序列.生物信息学分析显示基因的开放阅读框591 bp,编码166个氨基酸,相对分子质量21.66 kDa,等电点4.36 Genbank kF006346.SmNAC1蛋白的N-端具有保守的NAC_AB结构域,C-端高度变异.根据软件预测SmNAC1可能定位在细胞核.qRT-PCR分析YE+Ag+处理后SmNAC1在丹参毛状根中的表达变化,处理后2h表达量上调至对照的1.5倍,4～12 h保持2倍的表达量,36 h时下降至对照水平以下,推测SmNAC1可能参与了丹参毛状根对YE+Ag+的胁迫应答调节.

关键词：丹参、NAC转录因子、SmBF3-2、分子克隆、生物信息学

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资助基金：国家自然科学基金项目81173490,81130070

在线出版日期：2013-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2063-2067