铁皮石斛均一化全长cDNA文库的构建与序列分析

摘要：

目的:为了获得药用植物铁皮石斛功能基因的信息和筛选功能基因.方法:以SMART(switching mechanism at 5'end of RNA transcript)方式合成伞长cDNA,结合DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术,构建铁皮石斛茎组织的均一化全长cDNA文库.结果:该文库重组[率为93.9％,文库滴度1.3×106cfu·mL-1,插入片段平均大小1.5kb左右.随机挑取163个阳性克隆进行单侧测序,通过生物信息学分析,获得150个单一序列,其中147个序列与相应的同源蛋白匹配,GO(gene ontology)分类表明这些序列参与各种生化途径.8个序列包含了完整编码框,可判断为全长基因.结论:成功构建了铁皮石斛茎组织均一化全长cDNA文库,为满足铁皮石斛代谢途径等功能基因筛选和基因信息研究奠定了基础.

关键词：铁皮石斛、均一化、cDNA文库、序列分析

所属期刊栏目：38

资助基金：国家科技支撑计划项目2011BAI13B02-5

在线出版日期：2013-09-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：504-510