丹参2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶(SmMCS)基因全长克隆及其生物信息学分析

摘要：

目的:从丹参毛状根中克隆2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶(SmMCS)全长基因,并进行生物信息学分析.方法:根据丹参转录组数据提供的基因片段设计特异引物,采用RACE方法克隆SmMCS全长cDNA,并对SmMCS进行蛋白结构预测、序列多重比对和构建进化树等分析；同时采用实时定量PCR检测Ag+诱导子诱导丹参毛状根不同时期的SmMCS基因转录水平.结果:克隆的SmMCS全长cDNA由988个核苷酸组成,具有完整编码框,编码234个氨基酸,蛋白相对分子质量约24.6 kDa,等电点pI 8.53；实时定量PCR结果表明该基因受Ag+诱导后表达水平在12 h时急剧上升并达到最高值.结论:从丹参毛状根中克降得到一条SmMCS全长cDNA,为进一步研究丹参酮类成分的生物合成和萜类次生代谢提供靶基因.

关键词：丹参、2-C-甲基-D-赤藓糖醇2,4-环焦磷酸合成酶、cDNA末端快速扩增、生物信息学分析

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资助基金：国家自然科学基金项目30901965;全国优秀博士学位论文作者专项资金项目201188;北京市自然科学基金项目5102009;北京市优秀人才培养资助个人项目2011D005018000002

在线出版日期：2013-02-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：3365-3370