刺五加法尼基焦磷酸合酶基因的克隆、生物信息学及表达分析

摘要：

目的:克隆刺五加的法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,FPS)基因,并对其进行生物信息学和表达分析.方法:采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆刺五加FPS基因的全长cDNA序列.运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构与功能.并通过RT-PCR法检测FPS在不同器官中的表达情况.结果:刺五加FPS基因的cDNA全长为1 499 bp,开放阅读框长1 029 bp,编码342个氨基酸的蛋白,包含2个富含天冬氨酸(DDXXD)的保守功能域.FPS蛋白无跨膜区域,定位于细胞质中.RT-PCR的结果显示,刺五加FPS基因在各器官中均有表达,但表达最具有显著差异(P＜0.05).结论:首次分离并报道了刺五加FPS的cDNA克隆,并证实其在不同器官中的表达量不同,为进一步研究FPS对刺五加皂苷合成的影响和表达调控奠定了基础.

关键词：刺五加、法尼基焦磷酸合酶、克隆、表达分析

所属期刊栏目：37

分类号：R9(药学)

资助基金：国家自然科学基金项目30701086;河北省自然科学基金项目C2009001252;河北省自然科学基金-石药集团医药联合基金项目H2012401006

在线出版日期：2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1725-1730