基于居群DNA条形码的药用植物黄芩的产地鉴别研究

摘要：

目的:利用居群DNA条形码阐明不同产地(居群)黄芩的遗传分化程度,对其进行产地鉴别.方法:应用进化速率快和母系遗传的叶绿体DNA基因间序列,基于分子谱系地理学理论筛选出居群间遗传分化明显的片段,构建单倍型网状进化树,根据单倍型在网状进化树中的位置、出现的频率和地理分布范围的大小,划分出不同层次的居群DNA条形码,以用于地理分布范围宽窄不同的产地鉴别.结果:本实验筛选出3个叶绿体DNA基因间序列atpB-rbcL,trnL-trnF和sbA-trnH对17个黄芩野生居群进行分子谱系地理学分析,得到13个多态位点,共20个单倍型,其中3个分布最广、频率最高的单倍型可用于较广地域的产地鉴别,称为区域居群DNA条形码;3个分布次之、只存在于2～3个邻近居群的单倍型可用于较窄地域的产地鉴别,称为地区居群DNA条形码;另有8个仅局限在某一个居群的单倍型可用于特定居群的鉴别,称为居群特有DNA条形码.结论:叶绿体基因间序列在居群间存在明显遗传分化,可用于地理分布范围宽窄不同的黄芩产地鉴别.

关键词：黄芩、居群DNA条形码、遗传分化、产地鉴别

分类号：R22(中医基础理论)

资助基金：国家自然科学基金项目81130070;81072989;国家中医药管理局行业科研专项201107009

在线出版日期：2012-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1100-1106