丹参功能基因组学研究Ⅰ——cDNA芯片的构建

摘要：

目的:构建丹参cDNA芯片,为基因表达谱研究提供条件.方法:采用CTAB法提取丹参根总RNA,采用Pharmacia公司QuichprepTMMicro mRNA PurifiCation Kit分离mRNA后,通过在cDNA分子两端加上EcoR Ⅰ/Not Ⅰ接头,在T4多核苷酸激酶的作用下磷酸化,与表达载体λZAP Express Predigested Vector连接,然后用包装蛋白在体外包装连接产物,感染E.coli XL1-Blue MRF'构建成cDNA文库.挑取分离良好的噬菌斑进行PCR扩增,经过电泳检测、纯化、再次电泳检测后得到的克隆用于芯片点制.以丹参actin基因作为阳性对照,不含DNA的点样液和PolyA为阴性对照.结果:cDNA文库插入片段长度为500～2 500 bp.共得到4 354个克隆用于芯片点制.单色荧光(Cy3)杂交显示,阳性对照均出现杂交信号,阴性点没有杂交信号.整张芯片背景清晰,漏点少,杂交点为完整的圆形,芯片质量完好.结论:该芯片的制作为首张有关道地药材的cDNA芯片,为丹参功能基因组的研究提供了强有力的工具.

关键词：丹参、cDNA芯片

所属期刊栏目：32

分类号：S567(经济作物)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划2006CB504700;国家高技术研究发展计划863计划2003AA2Z2040

在线出版日期：2007-09-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1137-1141