基于生物信息学分析CD93基因在肺鳞癌中的表达及其化疗敏感性和预后的关系

摘要：

目的:应用生物信息学方法探讨CD93基因在肺鳞癌组织中的表达情况,并分析CD93基因表达与化疗敏感性及患者预后的关系.方法:通过The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库比较CD93 mRNA在肺鳞癌患者与正常肺组织中的表达差异.采用基因集富集分析(GSEA)CD93免疫相关通路;采用单样本基因集富集分析(ssGSEA)肺鳞癌患者的CD93基因表达情况与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系;采用pRRophetic算法,以IC50值为指标预测CD93基因表达与化疗药物敏感性的关系,并考察其与肺鳞癌患者预后的关系.结果:与正常肺组织相比,CD93 mRNA在肺鳞癌组织中低表达;CD93高表达的肺鳞癌组织样本显著富集在干扰素α反应、干扰素γ反应等相关信号通路;在肺鳞癌组织中,CD93表达水平与浆细胞样树突状细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞、调节性T细胞、骨髓来源的抑制性细胞浸润水平呈正相关.同时,化疗敏感性表示在肺鳞癌组织中,对于紫杉醇、长春瑞滨、多西他赛、顺铂等化疗药物,高表达CD93组IC50值高于低表达组.Kaplan-Meier结果显示,CD93表达水平与患者预后密切相关(P<0.05).结论:CD93在肺鳞癌组织中低表达,对传统化疗药物敏感;且CD93参与免疫相关通路,可作为肺鳞癌新型分子标志物.

关键词：肺鳞癌、CD93、免疫微环境、化疗敏感性、基因

所属期刊栏目：19

分类号：R734.2(肿瘤学)

在线出版日期：2022-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：25-31