基于真实世界数据的缺血性中风病分类探索与网络生物学机制研究
目的 基于真实世界数据挖掘缺血性中风病(ischemic stroke,IS)一般特征,探索关联核心症状群、中药与通路分析,并借助网络生物学方法验证分子机制.方法 收集并提取2016 年 1 月至 2018 年 12 月在山东省潍坊市中医院住院的IS患者病历资料,应用临床表型网络构建症状群模块;结合中医传统理论,确定优选模块及其核心症状群与中药;应用DAVID数据库进行KEGG富集分析,并以Jaccard 系数计算相似性,获得临床优选模块症状-中药共同通路,以备网络生物学验证.采用 HERB、SymMap、TCMID、TCMSP和TCM-ID等数据库获取优选模块核心中药靶点,从GeneCards、OMIM、TTD、DsiGeNET、SymMap、DrugBank和HERB等数据库中筛选症状群靶点.经Cytoscape中BisoGenet插件构建优选模块核心中药与症状群的PPI网络并筛选核心基因,应用MCODE富集分析潜在模块.采用Metascape对核心基因进行GO和KEGG富集分析,构建特异性通路网络以筛选关键靶点,并验证共同通路.结果 真实世界数据获得包含 362 种症状和 351 种中药的 7170 例病历,症状群模块 34 个,确定优选模块M3,症状5 个(头晕、头痛、视物旋转、头胀、耳鸣)与中药10 味(天麻、石决明、钩藤、首乌藤、炒栀子、黄芩、槲寄生、杜仲、益母草和茯神),KEGG通路 94 条.网络生物学共获取中药靶点361 个,症状群靶点 40 个,症状-中药核心靶点 238 个,GO功能 2402 个和KEGG通路182 条.验证共同通路 82 条,涉及丝裂原活化蛋白激酶 3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、MAPK1、RAF原癌基因丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase,RAF1)、RAC-α-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT1)、磷酸肌醇 3 激酶调控亚基 1(phosphoinositide-3-kinase,regulatory subunit 1,PIK3R1)等核心靶点,通路富集PI3K/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)、MAPK、Neurotrophin与神经突触传导通路等.结论真实世界数据发现肝阳上亢证是IS的核心病机,临床用药以天麻钩藤饮加减为主;网络生物学推测该中药组合在分子水平上通过多靶点与多通路的交互而发挥作用,为后续临床转化与基础实验指明了研究方向.
缺血性中风病、真实世界数据、网络生物学、机制研究、临床转化
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R259(中医内科)
国家重点研发计划;国家重点研发计划
2023-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1129-1137
