基于网络药理学和分子对接探索小承气汤治疗新型冠状病毒肺炎的分子机制

摘要：

目的 利用网络药理学和分子对接技术探讨小承气汤防治新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)的活性化合物及其机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索小承气汤中大黄、枳实、厚朴的活性化合物,并筛选出药物成分作用靶点.通过GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获取新冠肺炎的靶点,应用UniProt数据库进行靶点标化;通过Cytoscape 3.7.1软件和STRING数据库构建药物-化合物-靶标蛋白相互作用网络;通过DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析,预测其作用机制.最后将重要活性化合物与血管紧张素转换酶2(ACE2)、3C样蛋白酶(3CLpro)、RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)进行分子对接.结果 小承气汤中共包含3种药物、21种成分、51个共同靶点、3个基因簇.有效成分的靶标蛋白中前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基G肽(PIK3CG)和前列腺素内过氧化物合酶1(PTGS1)可能是主要作用靶点.KEGG富集分析出122条通路,主要富集在肿瘤、乙型肝炎等信号通路.分子对接结果显示,桉叶油醇和β-谷甾醇与RdRp、3CLpro、ACE2的连接度较好(桉叶油醇与RdRp、3CLpro、ACE2的结合能分别为-6.33、-6.40、-5.85 kJ/mol,β-谷甾醇与RdRp、3CLpro、ACE2的结合能分别为-6.86、-5.75、-7.70 kJ/mol).结论 小承气汤的核心活性化合物能通过多靶点、多信号通路发挥抗炎、抗病毒作用,从而发挥对新冠肺炎的防治作用.

关键词：网络药理学、分子对接、小承气汤、新型冠状病毒肺炎、分子靶点

所属期刊栏目：29

分类号：R737.31;R318;R544.1

资助基金：河北省自然科学基金;河北省中医药管理局科研计划项目;河北省中医药管理局科研计划项目

在线出版日期：2022-10-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：385-390