整合多数据库分析PM20D1基因与弥漫大B细胞淋巴瘤缺氧相关性及预后的关系

摘要：

目的:探讨肽酶M20结构域1(peptidase M20 domain containing 1,PM20D1)在人弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphomas,DLBCL)细胞中的表达及其与缺氧相关性和预后的关系.方法:通过GDC、TCGA、GTEx公共数据库分析PM20D1表达对DLBCL细胞增殖、迁移和凋亡的影响及其与患者预后的关系.通过对不同分组患者的富集分析及PM20D1与CD274相关性分析验证PM20D1是否为DLBCL的缺氧相关基因;采用ChEA、ENCODE和hTFtarget数据库分析上游调控PM20D1表达的转录因子(TF)和miRNA,以及差异表达PM20D1与化疗药物敏感性的关系.采用WB法检测PM20D1在正常淋巴细胞和DLBCL细胞中的表达水平,通过设计PM20D1的siRNA序列敲减目的基因,并采用qPCR和WB法检测验证SUDHL2和SUDHL10细胞中PM20D1的敲减效率,采用CCK-8法和Transwell实验分别检测敲减PM20D1对细胞增殖和迁移能力的影响,流式细胞术检测细胞凋亡水平.结果:PM20D1在DLBCL组织中高表达且患者预后差(P<0.05或P<0.01);富集分析显示,PM20D1高表达组与ssGSEA高分组主要涉及细胞电耦合通讯、甘油三酯代谢过程调节和细胞质翻译起始复合物过程,且PM20D1表达与免疫检查点CD274表达呈正相关(P<0.01,r=0.757).在SUDHL2和SUDHL10细胞中敲减PM20D1后,细胞的增殖和迁移均显著降低(均P<0.05),细胞凋亡明显增加(P<0.05).结论:PM20D1基因在DLBCL组织和细胞中高表达且与患者预后密切相关;PM20D1可能通过促进DLBCL细胞的增殖、迁移并抑制凋亡,从而促进DLBCL的发生发展.

关键词：肽酶M20结构域1(PM20D1)、弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、肿瘤缺氧、增殖、迁移、凋亡

所属期刊栏目：30

分类号：R733.4;R730.7(肿瘤学)

资助基金：上海市卫健委重点科研项目No.201640028

在线出版日期：2023-07-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：401-411