结直肠癌肝转移差异表达基因与信号通路分析

摘要：

目的:探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)肝转移的关键基因和分子机制,为CRC肝转移的治疗提供潜在靶点和生物标志物.方法:基于生物信息学方法从GEO数据库下载CRC肝转移基因表达数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),利用DAVID在线工具对DEG进行GO和KEGG富集分析,构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络图,筛选出CRC关键基因并进行预后分析.结果:从183例CRC组织标本和39例CRC肝转移组织标本中筛选出321个DEG,其中上调基因153个、下调基因168个.GO和KEGG富集分析结果显示,DEG的功能主要涉及蛋白质激活级联反应、炎症反应、细胞外基质、血小板脱颗粒、补体与凝血级联反应等.PPI网络图筛选出8个CRC关键基因为ALB、APOB、FGA、F2、APOA1、SERPINC1、FGG和AHSG.生存分析发现,SERPINC1、FGG表达高的患者预后不良(均P<0.05).结论:DEG的生物学功能和信号通路与CRC肝转移的发生发展相关,8个CRC关键基因可能是CRC肝转移治疗的潜在靶点,SERPINC1、FGG可能成为新的预后标志物.

关键词：结直肠癌、肝转移、生物信息学、差异表达基因

所属期刊栏目：27

分类号：R735.3+4;R730.5(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目No. 81573915

在线出版日期：2020-07-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：787-793