AGR2在乳腺癌中的表达及其功能的生物信息学初步分析

摘要：

目的:利用生物信息学方法分析前梯度蛋白2(anterior gradient protein-2,AGR2)在乳腺癌中的表达情况,并分析预测其所涉及的生物学功能及分子信号通路.方法:挖掘Oncomine和GEPIA数据库中AGR2在乳腺癌和正常乳腺组织中的表达情况,分析CCLE数据库中AGR2在乳腺癌细胞系中的表达水平,同时利用HPA数据库分析AGR2蛋白在正常和乳腺癌组织中的表达水平,并分析其表达与预后关系.Progno Scan分析AGR2表达与预后的关系从CCLE下载乳腺癌相关基因芯片并用R语言筛选AGR2共表达基因,利用GO功能富集分析和KEGG信号通路分析对AGR2相关共表达基因进行功能注释.结果:Oncomine 和GEPIA数据分析显示AGR2基因在乳腺癌组织中高表达,CCLE数据分析表明AGR2在乳腺癌细胞系中显著高表达,HPA数据库免疫组化结果显示乳腺癌组织AGR2蛋白相对于正常乳腺组织高表达;Progno Scan分析显示AGR2高表达提示乳腺癌预后不良.利用R软件共筛选出946个在乳腺癌中同AGR2共表达的基因,GO功能富集分析显示,共表达基因主要涉及蛋白定位到细胞周围、蛋白定位到细胞膜、细胞连接组装、细胞基质黏附、细胞连接组成等生物学功能;KEGG分析显示共表达基因主要参与乳腺癌和胃癌进程,并和蛋白聚糖在癌症中的作用及缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸降解通路相关.结论:AGR2在乳腺癌组织和细胞中均高表达,其可能是乳腺癌中潜在的促癌基因,有望成为乳腺癌治疗的新靶标.

关键词：乳腺、肿瘤、前梯度蛋白2、表达、预后、功能、信号通路

所属期刊栏目：27

分类号：R730.2;R737.9(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目No.81372843

在线出版日期：2020-06-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：302-308