基于microRNA调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因

摘要：

目的:基于microRNA (miRNA)调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因.方法:综合运用文本挖掘、网络构建和预测等生物信息学分析方法,挖掘卵巢癌化疗耐药相关miRNA和miRNA-靶基因数据,并构建miRNA调控网络,利用已知miRNA对卵巢癌多药耐药相关基因进行预测.结果:文本挖掘出11个与卵巢癌化疗耐药相关的miRNA,包括miR-130a、miR-214、let-7i、miR-125b、miR-376c、miR-199a、miR-93、miR-141、miR-130b、miR-193b*和miR-200c.在miRNA靶基因预测数据软件TargetScan中挖掘出47 077个miRNA-靶基因数据,而PicTar挖掘出1 675个miRNA-靶基因数据.在miRNA调控网络中,神经素1基因(neuropilins,NRP1)是最重要的Hub-基因.结论:利用已知miRNA构建miRNA调控网络进而预测卵巢癌多药耐药相关基因是一种行之有效的方法.NRP1极有可能在卵巢癌化疗耐药形成中扮演着重要的角色,是卵巢癌潜在的药物治疗靶点.

关键词：卵巢癌、多药耐药、基因、microRNA调控网络、预测、神经素1基因

所属期刊栏目：22

分类号：R737.31;R730.59;Q78(肿瘤学)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划资助项目No.2012AA02A507;广西自然科学基金资助项目桂财教2014-118号;广西科学研究与技术开发计划课题资助项目桂科攻14124004-1-24.Project supported by the National High-Tech R&D Program of China863 Program No.2012AA02A507,the Natural Science Foundation of the Guangxi Zhuang Autonomous RegionNo.2014-11,and the Science Research and Technology Development Plan of the Guangxi Zhuang Autonomous RegionNo.14124004-1-24

在线出版日期：2015-06-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：204-208