人胃肠道和胃肠外间质瘤microRNA表达谱的比较

摘要：

目的:比较消化道原发胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumors,GISTs)与胃肠外间质瘤(extra-gastrointestinal stromal tumors,EGISTs)nucroRNA(miRNA)表达谱的差异,分析其与肿瘤原发部位、突变类型等因素间的关系.方法:收集西京医院病理科的8例石蜡样本(5例GISTs,3例EGISTs),利用安捷伦人miRNA表达谱芯片(芯片覆盖866个人miRNA)进行分析.同时通过PCR扩增后直接测序,明确8例样本的基因突变类型.结果:芯片数据经非监督层次聚类分析,显示8例样本分为3簇,具有相同突变类型的1例胃部GIST和1例EGIST构成第1簇,2例胃部GISTs构成第2簇,其余4例(2例小肠GISTs和2例EGISTs)构成第3簇.将5例GISTs按部位分成2组(胃部和肠道),3例EGISTs分别加入miRNA表型相似的组,2组比较后发现12个miRNA表达有显著差异;预测的靶基因多数参与KIT/PDGFRA的信号转导,其中有5个在肠道组显著下调,部分已有报道与肿瘤的演进相关.比较GISTs和EGISTs的表达谱,发现仅有3个miRNA的表达差异具有统计学意义.结论:GISTs和EGISTs的miRNA表型相似,均与肿瘤部位及突变类型关系密切,因此miRNA表型的分析可能有助于GISTs在分子水平上的分类.

关键词：胃肠道间质瘤、胃肠外间质瘤、微小RNA、基因突变、石蜡组织

所属期刊栏目：18

分类号：R735;R730.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金30901735;西安市科技计划项目SF10284

在线出版日期：2011-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：190-195