基因芯片对骨肉瘤发病相关基因的筛查

摘要：

目的: 筛查骨肉瘤发病相关的基因,探讨其对于骨肉瘤发病的意义.方法: 采用3个骨肉瘤细胞株(MG-63、Saos-2、U-2OS)及1个成骨细胞株(Hfob1.19),提取总RNA ,合成生物素标记的cRNA,与Affymetrix(R) GeneChip(R) U133A芯片杂交,筛查骨肉瘤细胞差异表达≥2.0倍的基因.挑选其中10个差异表达基因,分别设计合成引物,用嵌合荧光(SYBR(R) Green Ⅰ)实时PCR法定量检测9 例新鲜骨肉瘤标本中该10个基因的表达水平,应用ABI Prism 7 000分析其与成骨细胞株之间的表达差异.结果: 在芯片包含的所有基因(约22 000个转录本)中,3个骨肉瘤细胞株与成骨细胞株相比较,共同上调58个基因,共同下调142个基因;这些差异表达基因主要包括能量和物质代谢基因、癌基因、信号转导基因、转录相关基因、细胞周期基因、细胞凋亡基因、免疫反应基因、抑癌基因等.在200个差异表达基因中挑选10个差异表达基因,利用实时RT-PCR检测9例骨肉瘤组织标本中该10种基因的表达结果与芯片结果完全相符.结论: 骨肉瘤是一种多基因病变,应用基因芯片可以发现该肿瘤发病相关的基因,为深入探讨骨肉瘤的基因机制奠定基础.

关键词：骨肉瘤细胞、成骨细胞、基因微矩阵、差异表达基因

所属期刊栏目：14

分类号：R738.1;R730.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金30170955

在线出版日期：2008-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：428-434