二代分子测序在软组织肉瘤中的应用价值分析

摘要：

目的:探索中国人群软组织肉瘤常见的基因变异;分析二代基因测序技术(next-generation sequencing,NGS)在软组织肉瘤诊疗中的价值.方法:本研究纳入北京大学肿瘤医院2018年1月至2020年12月接受NGS检测的软组织肉瘤(soft tissue sa-rcomas,STS)患者,分析基因变异的频率和分布特点;统计具有临床治疗意义的基因变异情况,包括符合美国国立综合癌症网络(NCCN)或中国临床肿瘤学会指南(CSCO)治疗建议、超适应证治疗药物,或正在招募中的针对特定变异的临床试验;探索STS的肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)水平及微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)状态.结果:108例患者中有74例(68.5％)的基因变异数≥1.共发现78种不同的基因变异,变异频率排名前10位的基因包括TP5312.3％(22/179)、MDM27.3％(13/179)、CDK45.6％(10/179)、CDKNB 3.9％(7/179),RB13.9％(7/179),ALK 2.8％(5/179),AT-RX 2.8％(5/179),MCL12.8％(5/179),FGFR12.2％(4/179),PIK3CA 2.2％(4/179).治疗获益方面,108例患者中有7例(6.5％)的突变基因符合指南治疗建议,31例(28.7％)具有超适应证治疗可能,56例(51.9％)可接受正在招募中的针对变异基因的STS临床试验,62例(57.4％)符合指南治疗建议或存在超适应证治疗可能或符合正在招募中的针对变异基因的STS临床实验.全组中位TMB值为2.42(0～60)muts/Mb,108例患者中有10例(9.3％)TMB值≥10 muts/Mb,24例(22.2％)TMB值5～10 muts/Mb,74例(68.5％)TMB值<5 muts/Mb.89例患者接受了MSI检测,仅1例患者为微卫星高度不稳定(MSI-H)(1.1％).结论:软组织肉瘤常见的基因变异包括TP53、MDM2、CDK4、CDKNB和RB1.通过NGS检测获得符合指南治疗建议的比例较低,但获得超适应证用药和临床试验建议的比例较高.TMB值、MSI状态对STS患者的临床意义还需进一步证实.

关键词：软组织肉瘤;基因变异;二代基因测序;肿瘤突变负荷;微卫星不稳定

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资助基金：本文课题受中华国际医学交流基金会项目编号:Z-2014-06-15331

在线出版日期：2021-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：820-827